В составе ФГУП «ГосНИИОХТ» имеется четыре обособленных структурных подразделения:
- филиал «Шиханы» (г. Шиханы Саратовской области);
- филиал «Обособленный завод № 4» (г. Новочебоксарск Чувашской Республики);
- отделение «Лебедянь» (пос. Большие Избищи Липецкой области);
- отделение «Енисей» (г. Красноярск).
Институт основан в 1924 году. В 1974 г. награжден орденом Ленина. В 1994 г. институту присвоен статус Государственного научного центра Российской Федерации.
Основными научными направлениями деятельности института являются:
- разработка технологий получения продуктов органического синтеза, лекарственных препаратов и биологически активных соединений;
- научное и технологическое обеспечение разработки и производства спецжидкостей и спецматериалов для нужд оборонной промышленности;
- разработка и промышленная реализация технологий переработки и обезвреживания промышленных отходов и методов рекультивации территории;
- выполнение комплексных химико-аналитических и физико-химических исследований веществ и материалов, включая промышленные отходы и объекты окружающей среды;
- создание новых материалов и композиций с заданными эксплуатационными показателями;
- математическое моделирование химико-технологических процессов;
- эскизное проектирование технологических линий и опытно-промышленных производств;
- исследования в области химии высокомолекулярных соединений, наноматериалов и сверхчистых веществ;
- токсикологические и фармакологические исследования веществ промышленного назначения, включая неклинические исследования лекарственных препаратов;
- функциональные исследования проблемы «структура — свойства» биологически активных органических и элементоорганических соединений, включая вещества природного происхождения и биорегуляторы;
- разработка технологий получения сверхчистых веществ из сырья природного и синтетического происхождения методом сверхкритической экстракции;
- разработка физико-химических и аналитических методов контроля малых и сверхмалых количеств химикатов в объектах окружающей среды и биообъектах;
- разработка методологии прогнозирования аварийного и систематического риска, порождаемого опасными химико-технологическими объектами;
- разработка математических моделей распространения и превращения химикатов в различных средах;
- создание и эксплуатация химических производств.